公司依据合同扣了我6月40%的工资，是否合乎法律

首先，公司扣你6月40%的工资可能不合法。依据《劳动法》相关规定，公司扣工资需遵循法律法规及公司规章制度。若扣除数额不合法合理，则可能违法。急辞工扣工资标准应由公司规章制度明确，且扣除数额需合法合理，否则可能侵犯员工权益。不及时处理，可能影响你的合法权益，如工资被过度扣除。
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常见处理方式为：协商、调解、仲裁、诉讼。你可先与公司协商，要求合理解释扣款依据并补足工资；若协商无果，可申请劳动调解委员会调解；仍无法解决，可向劳动仲裁委员会提起仲裁；对仲裁结果不满，可进一步向法院提起诉讼。
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急辞工扣工资，不同处理方式如下：1.若公司规章制度合法且扣款合理，则接受扣款现实；2.若规章制度不合法或扣款不合理，可先与公司沟通，要求解释并补足；3.沟通无果，向劳动监察大队投诉，由其介入调解；4.仍无法解决，准备材料向劳动仲裁委员会提起劳动仲裁；5.对仲裁结果不满，向法院提起诉讼。